Après la Seconde Guerre mondiale, les républiques membres de l'Union soviétique ont modifié leurs drapeaux pour y apporter des bandes de couleurs nationales. Le Tadjikistan a été le dernier des 15 à agir. Les précédents drapeaux tadjiks soviétiques étaient rouges avec l'emblème communiste habituel du marteau, de la faucille et de l'étoile au-dessus du nom de l'État en lettres d'or. Le 20 mars 1953, le Tadjikistan a ajouté deux bandes horizontales, blanches sur vert clair, à la bannière rouge soviétique avec son marteau et sa faucille en or et son étoile rouge bordée d'or. Le vert représentait la viticulture et les produits agricoles, tandis que le blanc représentait le coton qui avait rendu le Tadjikistan célèbre.
Le Tadjikistan a proclamé son indépendance le 9 septembre 1991, mais encore une fois, il a tardé à changer son drapeau. Le nouveau design, datant du 24 novembre 1992, reprend les quatre mêmes couleurs que le drapeau de 1953. On dit maintenant que le vert représente la production agricole, tandis que le rouge est un «symbole de souveraineté de l'État». Le blanc a la même signification que précédemment, en référence à la récolte de coton. La couronne au centre de la bande blanche est coiffée d'un arc de sept étoiles d'or: on dit qu'elles représentent l'unité entre les différentes classes sociales du pays, y compris les ouvriers, les paysans et les intellectuels.
